بر این اساس و با توجه به پرسش‌ها و ابهام‌های ایجادشده در خصوص نحوه اعمال معافیت مالیاتی موضوع تبصره‌ (۱) ماده‌ (۱۴۳) مکرر قانون مالیات‌های مستقیم نسبت به اوراق بهادار گواهی سپرده کالایی، مواردی ابلاغ شده است که در ادامه به تشریح دقیق آن می پردازیم.

۱. سپرده‌گذاری کالا نزد انبارهای مورد تأیید بورس و دریافت اوراق گواهی سپرده صادر شده در بورس کالا، به منزله فروش کالای سپرده‌شده توسط مالک اولیه تلقی نمی‌شود. لذا تا زمان فروش اوراق مشمول مالیات بر درآمد نیست. به عبارت دیگر با توجه به اینکه گواهی سپرده کالایی نشان‌دهنده مالکیت دارنده آن بر مقدار معینی کالا است، تا زمانی که مالک اولیه کالا، گواهی سپرده خود را به دیگری واگذار نکند، به دلیل تحقق نیافتن فروش و درآمد، مشمول مالیات نخواهد بود.

۲. هر زمان که مالک اولیه کالا مالکیت گواهی سپرده را به دیگری منتقل کند، این واگذاری به منزله فروش کالا محسوب می‌شود و در صورت کسب درآمد، مشمول ۱۰ درصد معافیت مالیات بر درآمد عرضه کالا در بورس کالا خواهد شد. به عبارت دیگر فروش اوراق مذکور به عنوان سرمایه‌گذاری در اوراق بهادار محسوب نمی‌شود و مشمول نرخ صفر مالیاتی برای مالک اولیه نخواهد بود.

۳. بدیهی است معاملات ثانویه میان خریداران گواهی سپرده کالایی در بورس (به استثنای خرید نهایی اوراق که به تحویل کالا از انبار منجر می‌شود) خرید و فروش اوراق بهادار محسوب شده و مشمول معافیت صددرصدی مالیات بر درآمد تبصره‌ (۱) ماده‌ (۱۴۳) مکرر قانون مالیات‌های مستقیم خواهد بود.